在这段文字中，明朝的内阁与清朝的军机处展现了不同的运作方式和职能分工。明朝内阁起源于翰林院，逐渐独立批答奏章，并在宣德年间正式迁至文渊阁。在这个过程中，它从皇帝侍从幕僚转变为一个有永久性机构，但同时也为宦官擅权创造了条件。
相比之下，清朝入关后恢复了明代的内阁制度，但它主要负责办理一般事务，而重要和机密的事务则由议政王大臣会议处理。此外，在康熙新政之后，皇帝开始亲自处理政务，因此军机处不再承担处理机要工作。
然而，在雍正时期，由于需要对西北战事进行管理，军机处被设立于隆宗门内，以便更好地保管机密文件。这里的工作环境更加严格，有着严密防范措施，即使是高级王公，也需得到皇帝特旨才能进入值房。而军机处的职责则是“掌军国大政，以参军务”，其主要任务是在宫内办公，为皇帝提供即时咨询服务。
总结来说，不同历史时期下的行政体系虽然都存在着类似的功能，如辅助君主决策等，但它们之间在组织结构、职能范围以及日常操作上的差异是显而易见的。例如，明朝内阁可能会涉及到太监朱批的问题，而清朝的军机处则非常注重信息安全，对外界干预极其严格。这两种制度各有优劣，有些时候能够有效地维持国家稳定，而在其他情况下，则可能导致决策闭塞，从而影响国家发展甚至最终走向覆亡。
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