在南明灭亡之后，仍有小朝廷在社会的余晖中掀起波澜。嘉定三屠是清军入主中原前后发生的事件，以报复反抗者的激抗和推行剃发令为由，制造了多起冲突和事件。其中，扬州十日和嘉定三屠尤为知名。此外，明军及民变军等亦在许多地方实行了政策，如扬州府在被清军屠城之前亦曾经长时间和多次被明军将领高杰和刘泽洗劫，以及农民武装政权大西的建立者张献忠在四川实行。
嘉定三屠，是1645年（南明弘光元年，清朝顺治二年）发生在清军攻破嘉定后，由于其弟一江伏击战中被杀而下令对城中平民进行的大事件。这次屠城持续了三个阶段，每个阶段都有不同的规模与程度，最终导致大量平民遇害。
第一轮屠城发生于七月初四，大雨滂沱之际，守城士民渐不能支，而李成栋趁机急攻破东门涌入城内，并下令鸣炮实施大屠杀。第二轮则是在李成栋离开后的七月二十四日，由朱瑛聚集民众再次控制嘉定的情况下，再次进行残酷的镇压。而第三轮则是在八月二十六日，当吴之藩率余部回归嘉定时，不期而至地再度引发了一场浩劫。
这连串悲剧性的事件最终导致城市毁灭、人民死亡，但也激励了一些人继续抵抗，并成为反对清朝统治的一个象征。在纪念这些英雄们的一生，他们不仅为了自己的国家，也为了他们所爱的人类付出了生命。在今天，这段历史依然是中国历史上一个深刻且动人的章节，它提醒我们无论时代如何变迁，对正义、自由以及人类尊严的追求永远不会消失。
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