大鹿岛毛文龙碑。图为靖江王府。
清顺治七年，明降将孔有德领兵攻陷桂林，改靖江王府为定南王府。顺治九年，农民起义军李定国攻占桂林，孔有德兵败，举火。
图为靖江王府。
袁崇焕对不听调度的毛文龙终于忍无可忍，一怒之下先斩后奏把他杀了，这消息传出一片哗然。但是，当尚方宝剑遭遇尚方宝剑时，让人真正起了杀心的是毛文龙割据东江，不听调度。
要知道，毛文龙是明朝任命的东江总兵，他天启三年加封左都督，并赐尚方宝剑。然而，他的桀骜不驯、拥兵自重、不服节制，都与袁崇焕的平辽方略格格不入。一上任，即宁远、锦州、蓟州各处军事要地都曾发生兵变，要整饬军纪，而袁崇焕认为首先就要解决这样的“独立王国”，否则辽东地区的政令军令就无法统一。
作为封疆大吏手握重兵又孤悬海外，毛文龍俨然就是个“土皇帝”，又怎么能甘心受袁崇焕的辖制和摆布呢？据李清《袁督师斩杀毛文龙始末》记载五月二十九日 袁崇焕抵达东江所属岛屿致书前来会商 毛文龍带領三千名親信將士赴會双方初見面氣氛還算融洽但當話題轉入設饷寧遠更定營制增設監司等具體問題時 毛文龍卻斷然拒絍 明確表示 不接受任何整頓建議同樣拿著皇帝賦予的大臣寶劍同樣個性強硬說一不二 的 袁崇 焕 怎麼會容忍部下中出現如此抗命 不從 的代表人物！於是 袁崇 焕 真正動了殺機
设局为了杀掉毛文龙，袁崇焕决定设一个局。在六月初五这天，在百余名亲卫与三千将士两军“校射领赏”活动中，由于官兵上下欢声笑语中间突然围住并拿下了随行人员，将话题转回更定营制增设监司的问题上，一声怒喝众将士齐上前拿下并剥去衣冠毫无戒备束手就擒。全数慑于军威没有一个人敢出言相救。而对于此事之后，对于被捕者以十二条罪状进行审判后，用着由皇帝所赐的大臣宝剑，将其斩落。这一切似乎是一个完美结局，但实际上却埋藏着深层次问题——这个事件背后的政治斗争和个人权力博弈，以及它如何影响整个国家的情势发展，是值得我们深究的地方。
该杀？或许还有其他方式可以处理这样的人物，但在当时那个紧张而复杂的情境里，无疑是一种极端的手段。而且，从历史角度看，那些关于他的评价和批评，也都是基于当时的人物观念和时代背景所产生的一系列复杂情感反应。
有人说他该死，有人说他不是必须被杀死，有些人则认为他的确存在一些错误行为，但是这些错误并不足以构成死罪。而现在，我们站在历史长河中的某一点，看向过去，这样的争议仍旧让我们感到迷惑——为什么会有这样一个结果？这是因为我们的理解往往只停留在表面的现象，而忽视了那些隐藏在幕后的深层次原因。当我们试图解开这个谜团的时候，我们发现问题其实比想象中更加复杂，更需要细腻地分析每一次选择，每一次行动背后的动机和后果。
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