在天启元年（1621年），明朝正面临与后金的战争压力，命令彝族土司奢崇明和安邦彦从四川永宁和贵州水西调兵前往辽东作战。然而，明政府拒绝发放军饷和军粮，并扣留了他们的薪饷。四川巡抚徐可求指责这支由奢崇明调集而来的两万名士兵大多数是老弱病残无战斗力的，因此要求遣返回永宁重新征调。
奢崇明愤怒起来，率领这些士兵攻占重庆，将徐可求杀害，并继续进攻合江、纳溪、遵义等地。随后，安邦彦加入了反旗，他的母亲奢社辉摄理水西事务，与安邦彦一同掌握着大权。当听到奢崇明起事时，他们也举起反旗，并占领了毕节、安顺、沾益等地。一时间，在西南地区，一些土司纷纷响应。
天启二年（1622年）二月，由于十万军队围困贵阳长达十个月，最终导致城中男女几近饿死，只剩下二百人生还。在接下来的几个月里，敌人的势力逐渐退缩，而朱燮元则成功收复江安并解除了对贵阳的围困。
至天启三年（1623年），朱燮元被任命为总督五省军务，他迅速行动起来，将叛乱平息。他首先命令滇部撤出乌撤，然后自己亲自率领大军驻扎陆广，以切断叛军交通线。此时，朱燮元得知奢崇明与安邦彦将要联合攻击永宁，便派出佯败的守将诱敌深入，当双方进入战斗之中，林兆鼎从三岔、三王国桢从陆广及刘养鲲从遵义同时进击，使得联军无法抵挡，最终遭到了彻底失败。最终，只剩下小儿子安位隐藏在水西山区，被迫乞降，这场著名的“奢安之乱”才终于告一段落。
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