南明建立初期
在李自成攻破北京后，清军主力仍在远方，因此崇祯帝有机会逃往福建。崇祯帝在福州称帝，改年号为隆武，是为南明政权。虽然此时北方已被农民起义和清军所控制，但南明政府依然试图通过海上运输来恢复对中原地区的影响力。
南明各朝相继灭亡
隆武元年（1645年），崇祯帝病逝，由其子朱由检继位，即弘光帝。在他的统治下，政治腐败、经济崩溃，加之内部矛盾激化，最终导致了弘光政权的迅速崩溃。接着，一系列短命的朝代相继出现，如永历、绍武、辅国等，每个朝代都以失败告终。
永历王朝的奋斗与悲剧
永历王朝是由朱由枟于1659年建立的一次尝试。他曾经一度获得了一些地方势力的支持，并且一度得到了西藏噶伦哲布登桑嘉措的大量援助。但由于缺乏足够的人力和物力资源，以及内忧外患，他最终只能流离失所，在云贵一带潜伏生活直至去世。
康熙入关前的混战局面
康熙五年（1666年）以前，中国大陆尚未完全归于清室掌控。这段时间里，大批流散民众涌向边疆地区寻求生存，其中不乏过往投降清军或加入当地抗清力量者。此时，不仅有着不同民族间的冲突，还频繁发生忠诚与叛变的情形，使得整个国家陷入了极度动荡之中。
康熙入关后的平定工作
康熙六年（1667年），康熙皇帝亲征四川，将残余抗击力量消灭殆尽。随后，他采取了一系列措施来稳固新生的中央集权制度，这包括整顿吏治、改革税收体系以及加强边疆防御等方面的手段。这一系列措施有效地巩固了他对全国范围内实行统一管理，为中国历史上的一个新的时代开启了序幕。
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