元朝灭亡的三大原因是：内忧外患、民族矛盾激化和经济困顿。这些原因相互交织，形成了元朝最终覆灭的历史背景。
首先，元朝晚期出现了严重的内忧问题。这主要体现在政治上。由于忽必烈之后的一系列皇帝统治能力不足，加之宦官专权，中央集权逐渐丧失，使得国家管理不善。例如，在足利尊氏领导下的日本即成功推翻了蒙古人的统治，并且建立起自己的封建政权。而中国内部也存在着强烈的民族矛盾。在蒙古人占据北方后，他们试图通过汉化来融合不同民族，而这并没有解决根本问题，只是加剧了社会矛盾。
其次，外患也是元朝灭亡的一个重要因素。这包括边疆地区不断发生的叛乱以及来自东北亚和西域等方向的军事冲突。此外，从14世纪开始，一系列自然灾害如旱灾、洪水频发，对农业生产造成巨大影响，这些都削弱了国家经济基础。
再者，经济困顿也是导致元代衰落的一个关键因素。随着时间的推移，由于资源枯竭和土地分配不均，以及对海上贸易关税过高等因素，最终导致商业活动减少，对国库收入产生重大打击。此时正值欧洲航海技术发展迅速，大量商品通过葡萄牙等国而进入亚洲市场，这直接威胁到了中国传统的手工业产品市场，同时也削弱了中国对国际贸易的地位。
综上所述，可以看出，当时期的人口流动性增强，也使得社会秩序更加混乱，加剧了各方面的问题。当明太祖朱元璋掌握大局，他采取了一系列措施，如整顿吏治、改革户籍制度、促进农业生产等，以此巩固中央集权，为新王朝奠定坚实基础。在他的带领下，便实现了一场从农民起义到建立新帝国的大变革，从而完成了对前一段时间繁多纷争与混乱后的清算与重组，将这个时代重新书写为一个新的篇章。
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