在洪武五年的某个日子里，朱元璋正在翻阅《孟子》时，突然间他的愤怒爆发。他命令将孟子的牌位从孔庙中移走，并且不允许与孔子的牌位一同供奉。同时，他还威胁说：“若有敢对此事持不同意见者，以不敬论处，并命金吾卫士射杀之。”这一消息传出，全朝文武官员都感到震惊和恐慌。
朱元璋深爱《论语》，对孔子有极高的尊敬，但他却如此厌恶孟子。这背后的原因主要有两个方面：首先是朱元璋本人的经历导致了他对文人产生反感。朱元璋出身贫寒，从放羊到做和尚，再到成为小军官，最终步步高升，一举掌握国家大权。他清楚自己缺乏文化背景，因此为了巩固统治需要通过文化手段来统一思想。但是，他天生就有一种排斥文人的情绪，对于儒生的看法总是低下眼眸。
其次，是因为孟子的“民本”思想触动了他的逆鳞。众所周知，孟子曾经说过“民为贵，社稷次之，君为轻”，这意味着人民的地位、国家利益比君王更重要。作为一个统治者，他应该以人民为中心，为江山社稷着想。而与孔子的“仁”相比，孟子的“仁”更多地体现在对人民身上。孟子强调，如果天子想要得到天下的拥护和稳定，就必须施行仁政，即爱护人民，不要强加给他们讨厌的事情。他认为，只要能够保护人民，那么即使是平凡的人，也能成为真正的国王；而如果残害百姓，那么即便拥有整个世界，也只会是一介孤家寡人。
在《离娄下》篇章中，孟子进一步阐述了这个观点：“君视臣如手足，则臣视君如腹心；君视臣如犬马，则臣视君如国人；君视臣如土芥，则臣视君如寇仇。”这表明，在孟子的看来，君主与臣民之间的关系是不成比例的，没有绝对的权威，而是取决于谁能保护谁。在这种情况下，如果一个暴虐无道的帝王存在，就应当被推翻，这并不是犯上作乱，而是在为民除害，如周武王推翻殷纣王一样。如果没有这样的理解和行动，无疑会让一切都变得毫无意义。
因此，由于自身文化上的劣势以及对于知识分子的先天嫉恨，加上被这样一种直接针砭现实、站在平民角度提出的“民本”思想所刺激，不得不把孙膑逐出文庙，这就是开头那一幕发生的情况。但由于他毕竟只是亚圣，是儒家的圣贤之一，他们自然不会让皇帝玷污了他，所以他们用了一条心眼儿解决问题：第二天夜里，他们向朱元璋报告称，他们夜观星象发现文星暗淡失色，有异象出现，因为得罪了上苍，这是一个不可忽略的大事。在这种迷信意识驱使下，被迫恢复了他的牌位，但为了防止再次引起争议，他干脆删去了一部分书籍，使其内容减少三分之一左右，可以说这是对他的思想的一种腰斩，让人难以忘怀的是，其手段之狠也令人叹服。
