在洪武五年的一个清晨，朱元璋正翻阅着《孟子》时，突然间，他的心情如同晴天霹雳般变了。随即，他下令将孟子的牌位从孔庙中移走，不再与孔子的其他圣人并列，并且严厉地指示说：“有敢对此表示不敬的官员，将被处以重罚，并由金吾卫士射杀。”接到这个命令，全朝文臣武将都感到震惊和不知所措。
朱元璋对《论语》情有独钟，对孔子充满尊敬。而孟子则是以发挥孔子的仁义思想而闻名于世，为“亚圣”之称。那么他为何会如此憎恶孟子呢？归根到底，可以总结为两大原因：
首先，朱元璋的个人经历使他深感对文人的反感。他出身贫寒，从放羊、做和尚到成为一名小军官，再逐步成长为一位伟大的统治者，这一切经历让他认识到要巩固自己的统治地位，就必须从文化上下手。但是，他本质上就不喜欢文人，也看不起他们。比如，当他命令制作案桌时，用独木板来避免损坏他的办公用品，有人询问其用意时，朱元璋回答：“秀才顽，使之坚硬，不致损坏我的办公用具。”这显示出，在他的眼中，文人们根本没有价值。
其次，孟子的“民本”思想让朱元璋感到极度不安。众所周知，孟子有一句著名的话，“民贵、社稷次之、君轻”，意思是人民的地位高于国家利益，而君王应服务于人民，与江山社稷相辅相成。在孔子的提倡“仁”与否定的人类自私心态相比较，更侧重于“民”的利益。孟子强调，如果天子想得到整个世界，让四海尽归己有，就必须实行仁政，用爱护的手段来赢得百姓的心。如果不是百姓喜爱的事物，那就不要强加给他们。这意味着只有真正关心人民的事情才能获得广泛支持。
在《离娄下》的篇章里，孟子还阐述过这样的话：“君视臣如手足，则臣视君如腹心；君视臣如犬马，则臣视君如国人；君视臣如土芥，则臣视君如寇仇。”这说明在 孝廉的心里，没有绝对的主权，只有相互关系。当谁能保护人民，即便那个人也可以称王；如果残害百姓，那么这样的领袖就是孤立无援。在这种情况下，即使是最尊贵的人也不配拥有天下的权力，即使掌握了天下，也应该被推翻——正像周武王推翻纣王一样，是为了消除害群之马。这表明孙膑并不认为所有的人都应该效忠一个单一的领导者。
最后，由于自身文化上的劣势以及对知识分子的先天性嫉妒，加上自己曾经流氓无赖的一面后来却坐上了皇帝宝座，这种复杂的情绪自然导致了对于知识分子的排斥，最终导致了开头故事发生的情况。不过由于孙膑作为儒家中的圣贤之一，其影响力不可小觑，因此即使是皇帝也难以触犯他的形象，所以很快就有人提出，他们夜观星象发现文星暗淡，一切都是因为忽略了太阳神的旨意。此话触动了皇帝的心弦，他意识到了可能因逼迫学者而得罪了上苍，无奈中恢复了一些原有的规矩，但同时又采取了一种更阴毒的手段：删书。在这个过程中，大约删掉了一半以上关于孙膑思想内容的大量资料，以此作为一种心理上的打击和控制手段。这也是当时政治斗争的一个缩影。
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