政治腐败
在明朝中期，政治腐败日益严重。皇帝朱由校即位后，权力下放给宦官和外戚，他们掌握了大批兵马和财政，使得中央集权失去控制。宦官魏忠贤更是独揽朝政，他的专权引起了其他官员的不满，最终导致了他的倒台，但这段时间造成了深远的影响。
军事弱化
随着内忧外患，明朝军队逐渐衰弱。由于长时间战争导致的人口损失、经济负担加重以及缺乏有效训练，这些都使得明军战斗力大减。在多次与蒙古等西北民族交战中，明军屡受挫折，而对抗倭寇则进一步削弱了海上力量。
经济困顿
经济问题也是一个重要原因。随着人口数量的大幅增加，加之农业技术停滞不前和土地制度不合理，使得粮食生产难以满足国民需要。这就导致了一系列社会问题，如饥荒、疾病流行等，同时也限制了国家对于外来威胁进行有效防御的手段。
文化思想变迁
文化思想上的变化也不可忽视。在晚期，儒家学说虽然仍为官方教育体系中的主要内容，但新兴的科学思想开始渗透进知识界。此时出现了一些对传统礼教有所挑战的声音，比如天文地理研究者杨守敬等人的工作，他们提出了新的宇宙观念，对传统封建秩序构成了挑战。
外患不断
最后，也不能忽略的是来自周围国家及民族的一系列侵扰。在东部是日本黑船来航迫使中国开放通商口岸；在西北则是清军入侵，这两股压力均极大地削弱了当时政府应对国内矛盾冲突能力，为其最终覆灭埋下伏笔。
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