在清顺治七年，明朝降将孔有德领兵攻陷桂林，并改靖江王府为定南王府。次年，农民起义军李定国攻占桂林，孔有德兵败后举火。这样的局势中，毛文龙作为明朝任命的东江总兵，不仅拥有尚方宝剑，还被加封左都督。
然而，当时的政治环境复杂多变。在袁崇焕接任辽东总兵官一职后，他发现毛文龙不仅桀骜不驯，而且拥兵自重，不服节制，这与袁崇焕的平辽方略格格不入。为了整饬军纪、统一辽东地区的政令军令，袁崇焕认为首先要解决这样一个“独立王国”。
据记载，在五月二十九日，袁崇焕抵达东江所属岛屿，与毛文龙会面。但当话题转入设饷宁远、更定营制、增设监司等具体问题时，毛文龙断然拒绝，并表示不接受任何整顿建议。这让身为皇帝赐尚方宝剑的大将士 袁崇焕难以容忍，最终决定设局杀掉毛文龙。
在六月初五的一场假象之下，袁崇焕命随从亲兵与毛文龙三千将士联欢，同时暗地授计属下，将毛文龍和随行人员截开，然后突然围住并拿下了他。最终，用著名的尚方宝剑斩杀了这位桀骛不驯的大将。
此事之后，即使是表扬，也透露出一种危险信号——对于皇帝而言，是对袁崇焕权力的限制；对于内阍而言，则可能是对其权力的削弱。此外，这也间接反映出朝廷内部对于如何处理边疆问题，以及如何防止地方武装割据的问题，对于这些敏感议题产生了新的争论。
至今学术界仍然分歧，有人认为杀掉毛文龙是正确之举，而另一些人则认为这是错误之举，无论从哪个角度看，都能看到这个事件背后的深层次意义以及它对历史发展产生的影响。而关于这一点，我们又该如何思考呢？
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