郑芝龙投降清朝的深层原因，源于其身份的转变，从一介商人到明朝末期的一位权势滔天的海上霸主。起初，他归顺明朝，是因为那份对故土的热爱和归属感，即便是身处江湖，心中也藏着“落叶归根”的愿望。但随着明朝政权摇摇欲坠，为了更大的利益与安全，他做出了艰难而痛苦的选择——投降了崭新的清朝政权。
然而，这位曾经在中国东南沿海横行无忌、甚至以劫富济贫自居的大海盗，在成为明朝招抚对象后，却未能完全摆脱原有的性格与习惯。他虽然有为国效力之志，但最终还是被自己的功成名就所迷惑，不料大清王朝建立后，他却迟迟没有意识到自己站在反动的一方。
当他决定再次改变立场，归顺新兴的大清王朝时，那不仅仅是一种出于个人利益或生存压力的行为，更是一种对历史潮流无知或不敏感的表现。大清王朝之所以优待他，并加官进爵，其实并非真正重视他的贡献，而是希望通过他来劝说他的儿子郑成功接受复杂的人生选择。然而，郑成功坚定地拒绝了父亲的劝诫，这使得郑芝龙失去了所有价值，最终只能在北京受到禁足，最终悲剧性地遭到了杀害。
