皇权专制与腐败
在明朝后期，中央集权体制变得越来越严格，地方官员的独立性和自主性被大幅削弱。由于长时间的战争和内部矛盾，中央政府出现了严重的腐败问题。高级官员往往通过贿赂或家族背景获得高位，而低级官吏则因缺乏能力而被任命。这种情况下，国家行政效率极低，加剧了社会经济问题。
农民起义与百姓苦难
随着土地兼并和人口增加，农民负担日益加重，他们受尽压迫，被迫参加抗击日本入侵时的“抵御战役”，导致许多人丧失了生活来源。同时，由于天灾人祸频发，如洪水、旱灾等自然灾害，以及蝗虫、瘟疫等鼠疫等传染病的大规模爆发，更是加剧了人民疾苦。这一切都为明末农民起义埋下了伏笔，最终成为推翻清朝统治的一个重要力量。
外患威胁
从16世纪中叶开始，一系列外部威胁不断侵扰中国边疆。日本入侵东北地区，对中国造成巨大的损失；蒙古、俄罗斯以及西方列强对中国边境进行无休止的骚扰，这些都给予明朝带来了前所未有的挑战，并且耗费大量财力物资。在这些压力下，明朝不得不不断地调动兵力防守，同时也影响到国内事务处理能力，使得国家整体形势更加吃紧。
文化衰退与思想封闭
随着时间推移，从朱元璋至崇祯年间，历届皇帝为了巩固个人政权，都采取了一系列排斥异己的手段，比如限制学术研究范围，将反对派人物处死或者流放。此外，由于宗教改革运动（例如儒家经典重新解读）的阻碍，也使得新思想、新知识无法有效融入社会，让整个文化界逐渐走向僵化和停滞，这对于促进科技发展和社会变革显然是一个重大障碍。
宦官专政与军事衰弱
宦官崛起是晚期明代政治的一大特点，以刘瑾最为著名，他利用皇帝信任掌握实权，并肆意干预国政。但这类宦官往往没有任何实际经验，只会将国家资源用于私利而不是提升国家实力的政策，使得国库空虚，无力应对内忧外患。此时，由于长期战争消耗，以及管理不善导致士兵饥饿疲惫，不断发生军队叛乱，这进一步削弱了政府的控制能力，为其最终崩溃埋下隐患。
