南明初年的监国之争
南明初年，随着李自成攻破北京，明神宗被迫西迁，并于1644年去世。其子朱由检即位为崇祯帝，但在崇祯帝未能有效巩固统治的情况下，他于1645年被景阳岗之变所杀。随后，清军入关，而南方各地纷纷拥立自己的皇帝，这便是著名的“三藩”事件。
张煌言、张献忠与王翊
张煌言因其家族背景和地方势力，被江南省的地方官员拥立为監國，是為绍武帝。在他的统治下，虽然有过短暂的稳定，但由于缺乏中央集权和有效的行政管理能力，最终在1653年被清军击败而死。张献忠则是在四川地区建立了一个独立政权，他以残酷的手段征服并统治四川，并且最终在1673年称帝，即顺治三年。但他对外部世界的扩张性质使得他同清朝之间长期处于对峙状态。
王翊与郑成功
王翊是福建将领，由当地士绅推举为监国，是為紹武帝。他虽然组织了一些抵抗清军的行动，但由于力量有限，最终在1662年的海宁战役中失败身亡。而郑成功则是台湾地区的一个重要人物，他领导了郑氏政权，在多次战争中对抗荷兰殖民者，最终于1662年驱逐荷人控制下的台湾，并设立了东寧政权。
吴三桂起义及其影响
吴三桂是满洲八旗中的高级官员，因不满皇太极改革措施及自己地位受损，被罢免出任边疆将领。在1680年代末至1696年的吴三桂起义中，他背叛清朝，与反动势力联合起来发动起义，最终导致了大规模的人口流离失所以及经济社会秩序的大倒退。这场战争也成为历史上著名的一场内忧外患混合型危机，对整个中国乃至亚洲产生深远影响。
清廷镇压与南明覆灭
面对这场巨大的威胁，康熙皇帝亲征，以强大的兵力镇压了吴三桂起义。在此过程中，大量人口遭到了屠杀和奴化，同时许多文化艺术作品也遭到了破坏。此外，还有许多曾经支持过或参与过反抗运动的人物都受到追捕甚至株连，加速了南明覆灭进程。到1699年左右，大部分反抗力量已经被消灭，而剩余的一小撮逃亡者也很快就要迎来结局。这一时期对于中国乃至世界历史发展产生了深刻影响，为后续几百年的政治格局奠定基础。
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