《明朝那些事》这部小说被许多读者奉为“史书”，而提到《明史》，他们就会高声反驳：“那是清朝篡改的，明朝怎么可能有那么多不足？”然而，当人们意识到作者并非真正的学者时，他们就搬出权威学者毛佩琦。他们认为，只要毛佩琦说了，那就是绝对正确，但实际上，毛佩琦在讲述历史时也存在错误。
比如，他在《百家讲坛》中谈论“朱元璋重刑治国之谜”时，说明朝官员考核由吏部和督察院负责，这是一个显然的错误。此外，在《细解明朝十七帝》一书中，毛佩琦指出帖木儿国向洪武年间的明朝纳贡。这是不可能的事情，因为洪武之前，大明王朝还未诞生。
相比之下，被人批评最烈的隋炀帝杨广，其疏通运河、连接黄河长江流域经济区的事迹，却常被忽视。至于毛佩奇教授关于老百姓血流成河的话，我们应当保持一定距离。
再看毛教授演讲中的其他硬伤，比如他说中国疆域“空前广阔”，但历史记载并不支持这一点。中国版图曾经扩张到了350万平方公里，但到了 明代缩小至353万平方公里，与秦汉时代相当。而清代则是面积最大，达到1300.6万平方公里（不含附属国），尽管其中包括许多无用之地，但比现在的大得多。
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