《明朝那些事》这部小说被许多读者奉为“史书”，而提到《明史》，他们就会高声反驳：“那是清朝篡改的，明朝在它里头简直就没好词可说。”然而，当人们意识到这本小说的作者并非真正的学者时，他们会搬出一位权威学者的名字：毛佩奇。他们认为一切关于明朝的伟大和光荣都是他说的，可事实上，他们并不了解，因为毛佩琦在他的电视讲座中多次指出了《明史》的错误，这些错误是如此显著，以至于他都不允许自己的演讲录像公开播出，担心误导了听众。
比如，在一次电视节目中，毛佩琦谈到了朱元璋如何通过重刑来治理国家，他错误地声称官员们的考核由吏部和督察院负责。这是一个历史事实上的严重错误。
此外，还有一些与朱元璋有关的事迹也被专家指出了不准确，如在《细解明朝十七帝》一书中，毛佩琦提到帖木儿国向洪武年间的大 明 朝纳贡。然而，“洪武”正是朱元璋唯一使用的一个年号。在洪武之前，大 明 朝还未诞生，所以帖木儿国怎么能向其纳贡呢？作为一个对明史有深入研究的人士，他怎么会犯下这样的低级错误？
相比之下，那个历来受人诟病最烈的隋炀帝杨广，却因为疏通运河，将黄河长江流域两大经济区联结起来，使得中华民族最终形成了一片牢不可破的大陆，被视为一种值得铭记的大功绩。至于毛佩奇教授所言老百姓因战争而流血成河，这种说法我们不敢苟同。
再看毛教授演讲中的其他硬伤错误，比如他说当时中国疆埸“空前广阔”。翻阅相关资料，我们发现事情似乎并非如此。那段时间内中国版图经历了几次扩张和收缩，最大的时候是在清代，而不是在后来的任何一个时代。
早在公元前3世纪秦王朝统一了中国，其基本疆域达到300万平方公里；到了西汉王朝（汉武帝），开拓了河西走廊20万平方公里，加上第13世王朝开拓云贵高原33万平方公里，总计350万平方公里；14世纪末期的明王朝时期，其国土面积缩小回到了353万平方公里，与秦皇时期相似；直到清代才达到了最大规模：17世纪初，大约有1000万平方公里；1644年东北地区2480万平方公里；1683年36000平方千米；1697年古1800多平方千米；18世纪初1720年的1600多平方千米青海66.6百万平方千米新疆190多百萬平方千米。而最后计算下来，从最初剩下的353百萬加上清代拓展947.6百萬共计13006.6百萬（不包括附属国）。虽然其中包含很多无用之地，但却比现在960余百萬更大。
