首先，朱棣本人并非完全无争议的继承人候选。虽然他是朱元璋的长子，但在其早年即因叛乱被废黜过一次，这在当时社会观念中可能会影响到他的皇位合法性问题。另外，由于历史上的种种事件，比如明太祖对外战争频繁以及内政多次变动，使得明朝内部权力斗争激烈，许多大臣和士绔子弟对于哪位皇帝更能稳定国家都持有不同意见。在这种情况下，即使是亲生儿子，也不能保证能够获得全体臣民的拥护。
其次，朱元璋对待儿子的态度也非常复杂。他既希望自己的儿子能够成为合格的君主，又担心他们可能会因为权力欲而导致国家分裂。这一点可以从他对其他几个儿子的处理方式来看：比如，他曾经让自己的另一个儿子朱标封为燕王，让另一名儿子封为晋王等。但这些安排都是出于试探和考验，而不是简单地将皇位传给他们。
再者，从家族关系上来说，明朝建立初期，其父母和兄弟之间存在着严重的问题。例如，当时正值洪武年间，对于父亲张世杰、母亲陈氏，以及哥哥张玉等人的处置充满了矛盾，这些矛盾直接影响到了整个家庭结构。而且由于这段历史背景，一些家族成员之间存在着巨大的恩怨情仇，这也是造成后续选择继承人的一个重要原因。
此外，还有一点不得不提的是，那时候中国社会是一个严格按照礼节和规则运行的地方，每个行为都必须符合一定的规范。在这样的环境下，即使是最高领导者也需要考虑到所有可能产生的问题，并通过各种手段来避免或减轻这些问题带来的负面影响。
最后，不可忽视的是政治策略层面的考虑。在现代政治学中，我们常常谈论“权力的游戏”，而这个现象在古代尤其显著。当时的人们知道，只有最强大的统治者才能确保自己及其家人的安全。而因此，他们往往采取各种手段去巩固自己的位置，因此，在选择继承人的过程中，也会根据个人利益或者更广泛意义上的国家利益进行决策。
总结来说，为啥朱元璋不选朱棣作为他的正式继承人，可以说是一系列复杂因素综合作用的结果，它包括但不限于诸如政治风险评估、家庭内部矛盾、社会文化规范、以及个人利益计算等方面。不过，无论如何，这一决定最终还是以盛极一时的大明帝国告终，不过它留下的历史痕迹至今仍然引发人们深入思考。
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