崇祯之变
在清朝建立的最初几年，明朝残余势力依然虎视眈眈。崇祯之变是指崇祯皇帝末年的一系列动荡事件，包括了李自成领导的农民起义和张献忠的割据活动。这两股力量不仅威胁到了明朝统治集团，还间接影响了清军入关的顺利进行。李自成虽然最终被吴三桂引来的清军击败，但他的起义却给后来者留下了深刻的教训。
杨廷秀案
杨廷秀是顺天府知府，他因抗拒满洲官员而被捕并处死，这一事件触发了一系列对满族官员权力的质疑与反抗。杨廷秀案不仅暴露了当时社会矛盾，也显示出明末士绔阶层对于外来政权的抵制和反抗。在此之后，不少地方官员也开始采取行动，试图维护自己与汉族士绔之间的地位。
吴三桂叛乱
吴三桂是顺治初年的重要将领，他曾在平定李自成起义中功勋卓著。但随着时间推移，他逐渐感到自己地位受限以及其家族利益受到侵蚀，最终爆发叛乱，并导致康熙帝亲征辽东。这场叛乱直接导致吴三桂被杀，其家族遭到极端惩罚，对于整个清朝来说是一个严重震惊。
崇禎十七年宦官专权
在崇祯十七年的最后一年，由于战争连连失利、财政枯竭，以及内忧外患交加，南京宫廷内部出现了一种独裁倾向。宦官魏忠贤等人借助皇帝之手一步步攫取大权，最终形成了一个集中央和地方实力于一身的大规模宦官集团。这一时期，即使是在战火纷飞中，也体现出了一种前所未有的政治腐败现象，为后世成为批判对象提供了丰富素材。
明亡后的遗迹与冲突
尽管1644年北京城已为多方势力所争夺，但这并不意味着国内所有地区都已经进入一个新的历史阶段。在一些偏远地区，如四川、贵州等地，一些割据势力如张献忠仍旧坚持着自己的独立王国。而这些地区长期以来积累起来的问题，如土地兼并、贫富差距扩大等，都没有得到有效解决，只是在冲突不断中继续加剧。此类问题直至更迭换届才得以部分缓解。
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