1645年冬，张献忠下令除大西政权官员家属以外，成都“城内居民一律杀绝”。两位洋教士亲临其境，目睹了这惨绝人寰的一幕。大开始。这两个西方传教士，被安排在城东和城南的空地上，对近二十万无辜市民进行屠杀。安司铎这样回忆道：“见无辜百姓男女被杀，呼号之声，惨绝心目，血流成渠，我欲救不能。”当时，被拘百姓无数，在南门沙坝桥边聚集，一见张献忠到来，都跪伏在地，为他祈求宽恕。
然而，这些请求都被拒绝了。安司铎回忆说：“此时被拘百姓无数，在南门沙坝桥边，一见献忠到来，都跪伏于地齐声悲哭求赦云：‘大王万岁！我等是你百姓，我等未犯国法，为何畏惧我？我等无军器亦不是兵亦不是敌乃守法良民乞大王救命赦我众无辜小民’云云。”但张献忠听后，并没有丝毫怜悯，只是厉声痛骂他们私通敌人，然后纵马入人群，用马踩踏并狂吼：“该死该杀之反叛！”随即命令军士动刑。冤哉！那些无罪的人们遭到了惨烈的处决，最终陷入沉默。
锦绣蓉城变成了荒凉旷野，无人居住。一片荒凉景象，不可言喻……凡城镇村庄房屋均纵火焚毁，而仓廪山林也遭毁灭。四乡失去所有生命迹象，全都是旷野。在三面受害尤为严重的情况下，只有北方幸存，因为那里正准备作为出川之路。
张献忠离开川江前往陕的时候，又下令全城四面纵火，使得公所私第、楼台亭阁，一派通红，有如火海。大明历代诸王所居宫殿及民间房屋均遭焚毁，不久之间，便将首府转化为焦土，将人们和动物变成了灰烬。
当张献忠离开川江时，他深虑各营中的妇女会成为行进障碍，便敕令次日将她们引至大营外全部杀掉。他除了留下自己的正妻和四名妓女外，还有嫔妃三百人，其中除留后妃二十人服役诸事外，其余二百八十个女人都被杀尽。此外，每个营中的妇女，也在一个地方集中起来，然后就开始乱砍乱打叫嚷着冤枉哭泣的声音震撼天地，那些尸体堆积如山血流成河。而这一天所消灭的女性数量达到五十多万。
之后，当两位洋教士目睹了他的死亡，并提供了一份关于他的结局珍贵资料：西历1647年1月3日，“有探兵入营告急”，报道说满兵马队五个人已经站在对面的高山上。当时，没有穿盔甲，没有携带长枪，只有一支短矛和几个小卒，以及太监一人跟随他一起骑马查看情况，但就在这个时候突然射来了箭矢直中他的肩膀然后穿透心脏，他立刻倒地鲜血涌出。他在地上滚动痛苦至极而亡。在清朝官员接管成都的时候，他们竟然找不到任何办公用的屋子，所以不得不将省府迁移到保宁府（现在的阆中县），直到顺治十六年（1659年）——即十四年后的时间才将省府迁回到成都。
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