宁王案：明朝初年，朱棣篡夺皇位，建立了新的政治格局，这一事件被后世称为“宁王之变”。在这个过程中，曾经的太子朱高熾因为反对其父朱元璋的继承人选择而被废黜，并最终遭到了杀害。考古学家通过对当时遗址的挖掘和研究，得出了一些关于这场宫廷政变的重要线索，如宁王府遗址中的建筑结构、武器装备以及一些文物等，都为历史学家提供了更为丰富的地质证据。
秦桧弑帝案：秦桧作为南宋时期著名的丞相，以奸猾狡诈著称，他通过各种手段掌控着整个朝政，最终导致了宋徽宗和宋钦宗两代皇帝被俘。秦桧利用这一机会，将自己的儿子秦琛立为太子，并极力推崇自己家族的地位。这一系列政治斗争背后的复杂情节，是中国历史上少有的权谋斗争典范。在考古发掘中，一些与秦桧有关联的大量文献资料得以发现，使人们能够更深入地了解他的政治手腕和影响。
明末农民起义：随着明朝内部腐败加剧以及经济危机日益严重，大批农民群体爆发了多次暴动，最终演化成了规模宏大的农民起义。李自成领导下的大顺政府虽然最终失败，但其出现无疑是明朝灭亡的一个重要因素。在进行现代考古调查时，可以从遗迹上看出当时社会矛盾激化的情况，以及大量难民逃难造成的人口流动情况。
明末三藩之乱：唐胜時、吴三桂、耿精忠分别控制了山东、江南及广西等地，与清军形成对峙状态。这场战争给当时的人们带来了前所未有的灾难，也标志着明朝走向衰落的一步。在探究这些战乱留下的痕迹方面，考古学家可以通过分析遗存文化层次来判断战争破坏程度，对比不同地区居民生活条件变化，从而更加全面地理解那段历史。
清兵入关：努尔哈赤统一各部蒙古族后创建清国，在1616年攻占沈阳建立起前清第一座都城。此后，他又于1625年攻占北京，即永乐门外，有名之呼应“内红外蓝”，即红旗军队（满洲）进驻紫禁城之后再由八旗护卫者进入外城区，这是满洲人第一次真正意义上的进入北京地区。这种对于城市征服和重新安排区域使用模式对于城市发展有着不可估量的影响，而现代考古工作则能揭示更多关于这一阶段社会结构调整和文化冲突的问题。
