《明朝那些事》这部作品，许多读者将其奉为“史书”，而提到《明史》，他们总是自信地说：“当然看过，就俩字还能不认识么”。然而，当他们意识到作者并非真正的学者时，他们便搬出权威学者的名义，比如毛佩琦。这些人并不了解，正是因为毛佩琦在《百家讲坛》中多次指出明史中的错误，这些错误才被揭露出来，以免误导年轻一代。
比如，在讨论朱元璋治国方式时，毛佩琦说明朝官员的考核由吏部和督察院负责。这显然是一个历史上的错误。同样，一些与朱元璋有关的历史细节也被专家们指出了问题，比如在《细解明朝十七帝》一书中，毛佩琦提到帖木儿国向洪武时期的明朝纳贡，但实际上洪武之前大明王朝尚未成立，这样的差错如何可能呢？
相反的是，历来受人诟骂最多的隋炀帝杨广，其疏通运河、联结黄河长江流域经济区等成就，却常被忽视。至于毛佩奇教授认为隋炀帝导致民变血流成河的事实，也让人难以苟同。
此外，毛教授在演讲中的很多史料分析都存在硬伤错误，如对明成祖扩展疆域的情况描述也是有争议的。在历史上中国版图曾经经历了多次扩张和收缩，从秦汉时期300万平方公里，再至清末1700万平方公里，每一次都是国家力量和文化影响力的延伸。而且，不乏有专家声称某个时代中国疆域达到最大，但这些数据往往需要更深入研究才能准确判断。此刻，我们只能通过不断探索去理解这片古老而又复杂的地球。
