政治腐败与中央集权的僵化
在元朝后期，政治腐败日益严重。皇帝对外征战失利，而内政则陷入一系列的官员贪污、奢侈和滥用职权的情况。中央集权制度虽然起初能够确保国家的统一，但随着时间的推移，这种制度也使得地方官员无法有效地反映民众的需求和问题，导致了民心大失。
军事上的弱点与边疆防御空虚
元朝军队在征服蒙古各部时曾经强大无敌，但随着时间推移，军队实力逐渐衰退。同时，由于长期战争和经济负担，边疆地区的人口大量减少，使得防御空虚。在黑死病爆发前后的数十年里，大量农民逃离边疆地区，从而削弱了元朝对这些关键区域控制力的基础。
经济危机与货币贬值
从13世纪末开始，中国经济进入了一段低迷时期。这主要是由于人口锐减、农业生产下降以及贸易路线改变等因素所致。此外，由于黄金短缺，加上政府过度印制铅钱造成货币贬值，这进一步加剧了社会经济矛盾，最终引发了人们对政府的不满和失望。
社会结构变化与文化衰落
元朝晚期，一些社会阶层出现了显著变化，如商人阶级崛起，他们通过贸易积累财富。但这种新兴阶层往往缺乏传统贵族的地位尊重，因此他们常常被排斥在政治生活之外。而学术界则发生了一系列知识分子的流离失所或转向宗教领域的情形，这些都体现出当时文化生态面临严重挑战。
自然灾害与疫病流行
自然灾害如洪水、干旱以及疾病爆发（如黑死病）对于任何一个帝国来说都是巨大的挑战。在元末明初这段期间，不断发生的大规模自然灾害和疫情不仅导致人口大量减少，也极大地破坏了社会秩序，对经济活动产生深远影响，最终成为推翻元王朝的一项重要因素之一。
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