军事腐败与士兵素质下降：
在明朝中后期，官员之间的权力斗争日益激烈，导致军队管理失效。将领们为了获取更多的利益，而不是为了国家安全和人民幸福而努力。他们往往以私人财产为依托，在军队中建立自己的势力，不仅影响了军队的战斗力，而且严重削弱了中央集权。
税收制度弊端与民众负担增重：
随着时间的推移，明朝政府对农民征收越来越多苛捐杂税，这些税收不仅包括正常之外，还包括各种附加性和非法性的赋税，如“一条鞭法”中的“两倍课”，以及地方官吏滥征等。这使得农民生活变得非常艰难，他们无法承受不断增加的经济压力，最终导致社会动荡、人口减少。
文化衰退与教育普及度下降：
由于长期战争和内部混乱，文人的创作活动受到极大限制。文学作品渐趋于古典化，无论是诗歌、小说还是戏剧，都缺乏新意。而对于普通百姓来说，由于教育资源匮乏，大部分人都无法接受到良好的教育。这进一步加剧了社会阶层固化，使得知识分子与人民群众之间形成隔阂。
自然灾害频发与农业生产困难：
明代末年，一系列连续不断的大旱、大洪水、大饥荒等自然灾害严重破坏了农业生产，对农村地区造成巨大的影响。这些自然灾害不仅减少了粮食供应，也引起了社会动荡，加速了社会矛盾激化，最终导致政治局势更加动荡不安。
外部威胁不断上升与防御体系薄弱：
从努尔哈赤统一后金至李自成起义期间，边疆地区经历了一次又一次侵扰。在这种情况下，即便是有能力的人也难以应对这些挑战。而且由于内部问题繁复，不断发生内讧，因此即使有时能够暂时平息边疆危机，但最终因内部原因而再次陷入混乱状态。
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