大凌河之役
在明朝晚期，边疆地区频繁发生叛乱和侵扰。万历年间，蒙古部落首领俺答儿不断地发动攻击，并且还曾经与明朝进行过和谈。在此背景下，大凌河之役成为了一场重要的军事冲突。这场战争起源于俺答儿对明朝边境城镇的攻击，以及后来的反击战。由于双方实力悬殊，这场战斗最终以明军失败告终，导致了大量士兵伤亡以及严重影响到边疆地区的稳定。
李自成起义
明末时期，一系列内忧外患使得帝国面临着前所未有的危机。当时，有许多地方出现了农民起义，其中最著名的是由李自成领导的起义。这场革命运动在各地迅速蔓延，其成员不仅包括农民，还有流氓、盗匪等社会底层人群。李自成声称自己是“大顺皇帝”，并建立了自己的政权，但他的统治很快便因内部矛盾和政治失当而崩溃，最终被清军所灭。
南京失陷
随着李自成军队进攻南京，该城在崇祯十四年（1641年）正式陷落。这一事件标志着北京政府彻底失去了控制中心，并引发了一系列连锁反应。南京失陷导致了经济、文化两个方面的大规模破坏，不仅城市遭到了洗劫，而且许多文物珍贵资料也遭到了毁灭性的损失。此外，由于交通阻断，北方与南方之间的人员交流几乎中断，使得整个国家进入了一个极度分裂的情况。
清初统一
随着李自成政权衰败，清朝入主中原后，在努尔哈赤和其子福临（即顺治帝）的领导下，对中国进行了一次全面统一。这段历史可以说是中国近代史上的一个转折点，它不仅结束了数百年的封建割据状态，也为中国进入现代化提供了可能。在这个过程中，清朝采取了一系列措施来巩固自身政权，比如强化中央集权、改革税收制度等，同时也通过多次征服周围民族，以确保国土安全。
明末三大案中的其他事件
除了上述几件重要事件之外，还有一些其他的小规模叛乱或地方斗争也是不可忽视的，如山西新野教案、新安教案等，这些都是当时社会矛盾激化的一种表现。而这些小型但持续不断的小爆炸性事件，为更大的社会变革埋下伏笔。
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