在元朝的统治下，色目人作为社会的管理阶层，他们负责征收税赋、管理城市等职责。朱元璋执政时，他要求色目人必须与其他民族通婚，这一政策体现了他推动民族融合的意愿。在法律上，朱元璋规定：“色目人氏，既居中国，许与中国人家结婚姻，不许与本类自相嫁娶。”此外，他还引入了伊斯兰教，并修建了南京净觉寺，以供回族进行宗教活动。这一系列措施促进了“色目人”与汉族文化的融合，使他们更加发展壮大。
然而，并非所有明朝皇帝都有朱元璋那样深远的视野和胸怀。他能够认识到一个民族兴起并对其予以宽容，这反映出特定时代对于多样性和包容性的需求。色目人的历史可以追溯到元代，当时他们是指来自中西亚、西亚洲和欧洲各民族的人们，是蒙古帝国征服后的居民之一。
在蒙古帝国期间，色目人经历了一段混血过程，最终形成了回族和撒拉族等少数民族。此后，他们的地位在社会阶层中排名第三，在蒙古之下、汉人之上。虽然没有组织过任何形式的民族成份辨别活动，但元朝政府将不同时间所征服的人群笼统划分为四个群体：蒙古人、色目人、汉人和南人。
尽管如此，“四等人民制”这一制度并未被发现于任何法令中，但它反映在一些政策和规定中。这种划分体现了一种对待不同民族的手段，其中モン古人は第一等級，而漢人的地位则相对较低。在法律上享有特权的是蒙古人才是。而至於科舉選拔方面，由於當時並無絕對規則，所以漢人的情況更為复杂，有些地方官员获得信任而獲得提拔機會較多，比南方地区。但總體來說，這種劃分顯示出了對不同種族與階層間權力差異的一種實踐。
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