1645年6月，清兵攻陷南京。同年，李自成身死九宫山。一年博弈，南明与大顺皆成输家，而满清江山在手。李万刚认为，这与史可法联清灭李的行为、缺乏调控诸将的器度不无关联。史未成千秋之业，而尽享忠烈之名，多是后世溢美。
当年史可法督师江北，李自成和清军鹤蚌相争的时候，此本为明朝从中获利、收复江山的大好时机，史可法居然上奏朝廷，言“但虏既能杀贼，即是为我复仇。予以义名，因其顺势，先国仇之大，而特宥前辜。借兵力之强，而尽歼丑类，亦今日不得不然之着数也。前见臣同官马士英已筹及此。”“万一虏至河上，然后遣行，是虏有助我之心，而我反拒之，虏有图我之志，而我反迎之。伏乞敕下兵部，会集廷臣，既定应遣文武之人，或径达虏主，或先通九酋（多尔衮）。应用敕书，速行撰拟，应用银币，速行置办。并随行官役若干名数，应给若干廪费，一并料理完备。定于月内起行，庶款虏不为无名，灭寇在此一举矣。” 但是历史已经证明，他的这种看法不过是异想天开。
史可法此时面对的是两个敌人，一个是“寇”，即李自成，一个是“虏”，即清军。不过，此时“寇”、“虏”之间也正进行着激烈的争夺，“寇”被“虏”赶出了北京，逃亡到陕西，而清军的主力，也被李自成农民军牵制住而暂时未能兼顾南明小朝廷。常言道，鹬蚌相争，渔人得利，这正是明朝从中获利，甚至光复明朝的大好时机，刚刚成立而力量弱小的南明小朝廷不可能两面出击，胜负手在于在于把握好自己的主攻方向。但作为南明的兵部尚书和军事第一把手的史可法，却做出了错误的选择，毫不犹豫地决定“攘外必先安内”，选定处于北方的“寇军”李自成为敌人，而对外族的“虏军”，则置之不理，甚至幻想“联清抗寇”，这不能说不是一个致命的战略错误。
