农业和手工业的发展也促进了明初商业和城市经济的繁荣。 南京是当时国家的首都，人口近20万。 这里人口稠密，住宅楼鳞次栉比，一个酒店房间，里面有一张床，一个月就要几千块钱。 为了征收商业税，明政府在京都设立了宣传部，在府内设立了税务部门，并在府县设立了税务局和国库。
洪武时期，营业税较轻，为“三十之一”。 明朝时期还铸造过“洪武通宝钱”。 由于铜币笨重、价值低，不便大规模贸易，朱元璋决定发行纸币，创制“明朝宝钞”，禁止民间使用白银。
然而，明朝之所以禁海，却源于朱元璋：是因为朝廷需要解决内政，进攻北元。 由于无法清理张士诚、方国桢等叛军残部以及逃往海上的海盗，于是下令实施海禁。 这也造成明朝中后期沿海平民无法谋生。 倭寇灾难影响深远，明朝发展资本主义来不及了。
明代商业的发展给人们带来了丰富的物质享受，但也造成了传统儒家所倡导的“士、农、工、商”等级秩序的混乱以及拜金主义和奢侈享乐主义的盛行。 这些都使得明末士绅强烈抵制商业的发展，甚至将明朝的灭亡归咎于商业繁荣带来的种种弊端。
一是防止商人队伍扩大，千方百计阻止农民做生意。 苏、宋、贾、胡、杭五县地狭人稠，“贫民无田可耕，常逐末利”。 洪武三年（1370年），“令五县无田之民于临濠开田”。 （《明太祖实录》卷五十三）。采取安置定居的方式，堵住失地农民的商路。如果说这种方式还带有温和的仁慈味道，那么下面的方式就散发着“血腥味” 。
洪武二十四年（1391年），太原府繁峙县知县报告说，该县有300多名农民离家出走。 他们这些年的恩情没有还清，乞求被侍卫追杀。 朱元璋读完奏章后，下令户部：百姓已安定，迁回故里。 即使吃饱穿暖了，又怎么会愿意轻易离开家乡呢？ 允许他“随处占籍”，“若有不务农而游牧、无业游民者，拘之”（《明太祖实录》卷二十八）。
农民离开家乡，不务农，专做生意，就会被视为游手好闲，不务正业，会被抓起来。 用赤裸裸的暴力将农民赶回田地，不让他们离开土地。 商户数量限制在一定范围内。
其次，它规定了商人的低社会阶层。 中国古代居民的等级制度是士、农、工、商，商人处于最底层。 为了区分优劣，统治者实行居民按等级消费的方法。 不同阶层的居民，房屋的高度、大小，以及衣服的材质、款式都有很大差异。
明朝建立后，朱元璋以消灭胡俗、恢复礼制为己任，继承了这一制度。 洪武十四年（1381年），他下令“农民之家，准穿丝纱、丝布，商人之家，只准穿丝布”。 。 例如，在农民家里，如果家庭成员之一是商人，则不准穿丝纱”（《大明会典》卷61）。朱元璋规定商人所用的服装材料较差。应该说，这是朱元璋等级观念的制度外化。
